此文章轉(zhuǎn)載自:百代生物
siRNA轉(zhuǎn)染是分子生物學(xué)常見的實驗之一。在siRNA轉(zhuǎn)染實驗中,siRNA轉(zhuǎn)染試劑的選擇尤為關(guān)鍵,需要綜合考慮轉(zhuǎn)染試劑的轉(zhuǎn)染性能、細(xì)胞毒性和操作方便性。
目前,實驗室常用的siRNA轉(zhuǎn)染試劑品牌主要有賽默飛的Lipo3000、 RNAiMAX和百代生物的RFect與RFect V2。
其中,RNAiMAX是國際公認(rèn)的siRNA轉(zhuǎn)染試劑權(quán)威產(chǎn)品,RFect是國產(chǎn)知名siRNA轉(zhuǎn)染試劑,RFect V2是RFect 的最新升級產(chǎn)品,很多實驗室反應(yīng)其siRNA轉(zhuǎn)染性能非常優(yōu)異。
RNAiMAX與RFect V2比較,各自的siRNA轉(zhuǎn)染性能如何,本文擬簡要敘述如下。
一、siRNA轉(zhuǎn)染性能
siRNA轉(zhuǎn)染性能,無疑是評價一款siRNA轉(zhuǎn)染試劑實力的首要指標(biāo)。不僅要看轉(zhuǎn)染陽性率,更要看基因沉默效率。
RFect V2的最大突破就是專門配置了Trans Enhancer,又叫siRNA轉(zhuǎn)染增強劑,可有效降低細(xì)胞膜的免疫排異反應(yīng)的同時,顯著提升了siRNA轉(zhuǎn)染的效率,較升級前的RFect siRNA轉(zhuǎn)染試劑的轉(zhuǎn)染效率還可高出5-30%。
那它的轉(zhuǎn)染性能表現(xiàn)和RNAiMAX相比又如何呢?我們實驗室按照兩款試劑的說明書,以24孔板的推薦比例,在用于做體外質(zhì)控的Hela細(xì)胞融合度達(dá)到30-50%時,
分別以1.5μL的RFect V2和1.5μL的RNAiMAX轉(zhuǎn)染試劑配制轉(zhuǎn)染復(fù)合物進(jìn)行轉(zhuǎn)染,48h在熒光顯微鏡下觀察其轉(zhuǎn)染陽性率。
結(jié)果顯示,兩者的轉(zhuǎn)染陽性率都可達(dá)90以上,說明同等量的轉(zhuǎn)染試劑,RFect V2與RNAiMAX的轉(zhuǎn)染陽性率不相上下。
如果說轉(zhuǎn)染陽性率只是一個直觀的結(jié)果,并非是驗證兩者轉(zhuǎn)染性能的“金標(biāo)準(zhǔn)”,那么還需要通過RT-qPCR來檢測其基因沉默效率從而得出結(jié)論。
為此,我們將能夠敲降SSB基因的小干擾核酸分別通過RFect V2和RNAiMAX轉(zhuǎn)染進(jìn)Hela細(xì)胞,利用RT-qPCR檢測轉(zhuǎn)染24h后SSB的mRNA表達(dá)水平。
如圖所示,使用RNAiMAX轉(zhuǎn)染的實驗組CT值分別為21.91、21.95,使用RFect V2實驗組的熒光定量檢測結(jié)果相比于RNAiMAX略高出0.13-0.14個CT值,兩者結(jié)果非常相近,表明RFect V2和RNAiMAX轉(zhuǎn)染siRNA沉默基因的效率基本一致。
二、細(xì)胞毒性
細(xì)胞死亡率對細(xì)胞轉(zhuǎn)染實驗結(jié)果的影響很大,尤其是我們在研究基因沉默效率時,死亡細(xì)胞的那部分也會表現(xiàn)為目標(biāo)mRNA表達(dá)水平的降低,因此siRNA轉(zhuǎn)染試劑必須對細(xì)胞作用溫和,才能實現(xiàn)實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。
RFect V2使用了新型可降解納米材料,和升級前的RFect相比,細(xì)胞毒性更低,并且成分上區(qū)別于以陽離子脂質(zhì)體為主要成分的RNAiMAX。
眾所周知,siRNA轉(zhuǎn)染試劑的毒性越低,其要求的轉(zhuǎn)染密度也越低。
在這方面,無論是RNAiMAX,還是RFect V2,都做到了轉(zhuǎn)染密度在30-50%時就能取得高效的轉(zhuǎn)染結(jié)果。
根據(jù)我們實驗室的數(shù)據(jù),使用RNAiMAX轉(zhuǎn)染Hela細(xì)胞后,細(xì)胞死亡率約為10%左右,使用RFect V2轉(zhuǎn)染Hela細(xì)胞后,細(xì)胞死亡率只有5%左右,似乎還略優(yōu)于RNAiMAX。
可以說,RFect V2在細(xì)胞毒性方面的表現(xiàn)是令人驚喜的。
三、操作簡便性 以研究者的角度出發(fā),實驗的簡便性也十分重要。主要看兩方面,一方面是需不需要特殊培養(yǎng)基,第二方面是需不需要換液。
特殊培養(yǎng)基一般是用來配制轉(zhuǎn)染復(fù)合物的,因為血清的存在往往會影響轉(zhuǎn)染復(fù)合物的形成,所以說必須使用減血清培養(yǎng)基或是無血清培養(yǎng)基。
RNAiMAX的說明書中就已明確指出需要使用Opti-MEM減血清培養(yǎng)基來稀釋轉(zhuǎn)染試劑和siRNA,而試劑盒內(nèi)并不提供這種培養(yǎng)基,因此實驗者還需額外購買。
這方面,RFect V2盒內(nèi)配置有專研的轉(zhuǎn)染增強劑,可完全替代無血清培養(yǎng)基,不僅提升了轉(zhuǎn)染效率,也省去了購買特殊培養(yǎng)基的開支,為研究者提供了便利。
在換液問題上,研究者要根據(jù)每個轉(zhuǎn)染試劑的說明書來。
RFect V2不僅有很強的抗血清干擾能力,無需在轉(zhuǎn)染前更換無血清培養(yǎng)基,而且由于對細(xì)胞毒性極低,因此也無需在轉(zhuǎn)染4-6h后進(jìn)行換液,換液反而可能造成轉(zhuǎn)染效率降低。
RNAiMAX同樣在說明書中表明無需換液,但有些科研者在分享轉(zhuǎn)染經(jīng)驗時還是建議轉(zhuǎn)染后4-6小時最好更換培養(yǎng)液,可能對于一些敏感的細(xì)胞如果不及時更換新鮮的培養(yǎng)基,細(xì)胞死亡率還是比較高的。
不過,對于大多數(shù)耐受性強的細(xì)胞,RNAiMAX還是有非常不錯的轉(zhuǎn)染效率的。因而,研究者在選擇使用RNAiMAX時,可根據(jù)細(xì)胞對轉(zhuǎn)染試劑的敏感度自行判斷是否需要換液。
總的來說,RFect V2在各方面都有媲美RNAiMAX的性能,對于研究者來說,確實是一個不錯的siRNA轉(zhuǎn)染試劑新選擇。