label free 非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)
蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)(label-free)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號(hào)強(qiáng)度,從而對(duì)肽段對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)進(jìn)行相對(duì)定量。Label-free的技術(shù)優(yōu)勢(shì)就在于蛋白質(zhì)不需要進(jìn)行標(biāo)記,所需樣品總量少,耗費(fèi)低。
技術(shù)原理
label free流程示意圖
非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)近年來成為重要的質(zhì)譜定量方法,按照其原理分,主要有兩種。其中spectrum counts類的非標(biāo)記定量方法,發(fā)展比較早,也形成了多種算法進(jìn)行定量,但是主要的原理都是根據(jù)MS2的鑒定結(jié)果作為定量的基礎(chǔ),各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標(biāo)記定量方法的原理是以MS1為基礎(chǔ),計(jì)算每個(gè)肽段信號(hào)在LCMS質(zhì)譜上的積分,這個(gè)也是本公司所采用的Maxquant算法的原理。
服務(wù)流程
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1.無需昂貴的同位素標(biāo)簽標(biāo)記,實(shí)驗(yàn)耗費(fèi)低,操作簡單;
2.對(duì)樣本的操作少,并且不受樣本數(shù)目的現(xiàn)在,客服了標(biāo)記定量技術(shù)在對(duì)多個(gè)樣本進(jìn)行定量方面的缺陷;
3.可以檢測到的肽段動(dòng)態(tài)范圍可以達(dá)到4個(gè)數(shù)量級(jí)以上,提高低豐度蛋白的檢出率和非標(biāo)定量的準(zhǔn)確性;
4.可以檢測不同組樣本中有無差異的蛋白變化;
5.樣本需求量少
儀器類型
Thermo Scientific Q Exactive
樣本要求
1.蛋白運(yùn)輸:24小時(shí)內(nèi)可以4℃運(yùn)輸;
2.蛋白長期保存:-20℃;
3.待檢測蛋白要求:蛋白量最低300μg,濃度最低要求為1μg/μl,否則同位素?zé)o法標(biāo)記;
4.蛋白提取試劑要求:使用普通的組織、細(xì)胞裂解液即可,切忌不要使用二維電泳試劑提取;
5.直接提供組織或細(xì)胞:動(dòng)物、微生物組織濕重>10mg;植物鮮嫩組織>100mg;細(xì)胞量>107個(gè);血液體積>500μl。