該文章轉(zhuǎn)載自:莫納生物
眾所周知,逆轉(zhuǎn)錄是 RT-PCR 實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵一步,逆轉(zhuǎn)錄酶也是此步驟中不可或缺的“靈魂角色”,那么,小伙伴們對(duì)它們是否有著充分的了解呢?
今天,莫納生物逆轉(zhuǎn)錄系列知識(shí)科普正式開(kāi)啟!本系列共分為三部分,這一期,琴子將為您帶來(lái)第一部分——酶的發(fā)現(xiàn)、逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程及 M-MLV 與 AMV 的區(qū)別。
接下來(lái)就請(qǐng)與我一同走進(jìn)逆轉(zhuǎn)錄的世界吧!
逆轉(zhuǎn)錄的實(shí)驗(yàn)?zāi)康木褪且咝У孬@得 cDNA,要達(dá)成這個(gè)目的,就要考慮如何選擇試劑。而在試劑選擇中,酶的選擇是非常關(guān)鍵的。
逆轉(zhuǎn)錄酶,全稱(chēng)是依賴(lài)于 RNA 的 DNA 聚合酶,最早發(fā)現(xiàn)于部分 RNA 病毒中,具有逆轉(zhuǎn)錄活性,能夠以單鏈 RNA 為模板合成 DNA 的酶。
逆轉(zhuǎn)錄酶最初是在 1970 年由霍華德·馬丁·特明(Howard Temin)和戴維·巴爾的摩(David Baltimore)從 RNA 病毒中發(fā)現(xiàn)的。他們并因此獲得 1975 年度諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。
模板:逆轉(zhuǎn)錄病毒單鏈 RNA 的基因組
引物:tRNA(主要是色氨酸 tRNA)
酶:逆轉(zhuǎn)錄酶(RNA 指導(dǎo)的 DNA 聚合酶活性)
過(guò)程:在模板、引物及酶的作用下合成一條 DNA 單鏈,為互補(bǔ) DNA(complementary DNA,cDNA)與模板形成 DNA-RNA 雜合雙鏈。
酶:逆轉(zhuǎn)錄酶的 RNase H 活性
過(guò)程:水解雜合雙鏈中的 RNA,得到與 RNA 互補(bǔ)的 DNA 單鏈(cDNA)。
模板:新合成的互補(bǔ)單鏈 cDNA
底物:dNTP
酶:逆轉(zhuǎn)錄酶(DNA指導(dǎo)的 DNA 聚合酶活性)
過(guò)程:以 cDNA 單鏈為模板,以 dNTP 為底物,再合成雙鏈 DNA。
人類(lèi)免疫缺陷病毒1型的逆轉(zhuǎn)錄酶(PDB:HIV)
莫洛尼鼠白血病病毒的逆轉(zhuǎn)錄酶(MMLV)
禽成髓細(xì)胞瘤病毒的逆轉(zhuǎn)錄酶 (AMV)
維持真核細(xì)胞的染色體端粒存在的端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶
AMV 和 MMLV 是分子 PCR 檢測(cè)常用的兩種逆轉(zhuǎn)錄酶。AMV 反轉(zhuǎn)錄酶來(lái)源于禽類(lèi)的病毒,RNaseH 活性較高,一邊做反轉(zhuǎn)錄,一邊就把 RNA 降解了,所以 AMV 反轉(zhuǎn)錄酶的反轉(zhuǎn)錄效率比較低。M-MLV 反轉(zhuǎn)錄酶來(lái)源于鼠類(lèi),它的 RNaseH 活性較低,所以反轉(zhuǎn)錄效率是比較高的。雖然野生型 M-MLV 逆轉(zhuǎn)錄酶的熱穩(wěn)定性差,抵抗二級(jí)結(jié)構(gòu)的能力弱,但可以通過(guò)基因改造彌補(bǔ)這些不足。
(野生型)M-MLV 和 AMV 的區(qū)別
我們知道逆轉(zhuǎn)錄酶由不同生化活性的不同結(jié)構(gòu)酶組成,其中逆轉(zhuǎn)錄活性和 RNaseH 活性決定了逆轉(zhuǎn)錄酶的性能。逆轉(zhuǎn)錄活性與酶的熱穩(wěn)定性密切相關(guān)。
下一期,我將帶大家詳細(xì)了解逆轉(zhuǎn)錄酶 RNaseH 活性和熱穩(wěn)定性對(duì)逆轉(zhuǎn)錄的影響,以及如何選擇逆轉(zhuǎn)錄酶,大家敬請(qǐng)期待吧!
莫納生物逆轉(zhuǎn)錄酶具有高熱穩(wěn)定性,較低 RNase H 活性,大幅提升了逆轉(zhuǎn)錄效率和 RNA 復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)的耐受性,特異性更好、產(chǎn)率更高、更容易獲得全長(zhǎng) cDNA,最長(zhǎng)可達(dá) 12kb。
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